首個桃完整泛變異組圖譜發(fā)布
時間:2025-05-06 09:20 來源:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所 作者: 李勇
4月22日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所桃資源與育種創(chuàng)新團隊發(fā)表了首個桃完整泛變異組圖譜,研究發(fā)現(xiàn)了70.6%的新變異和3289個新基因,揭示了全球桃的親緣關(guān)系和進化路線,開發(fā)了基因發(fā)掘新策略,實現(xiàn)了基因及功能變異的“一步定位”。相關(guān)研究發(fā)表在《分子植物(Molecular Plant)》上。


該研究利用1020份桃種質(zhì)基因組數(shù)據(jù),檢測了結(jié)構(gòu)變異等目前已知的所有變異類型,構(gòu)建了首個完整變異組圖譜,包含70.6%的新變異;構(gòu)建了泛基因組圖譜,鑒定了3289個新基因,發(fā)現(xiàn)桃馴化和進化過程中基因數(shù)目顯著增加;解析了全球桃基因漸滲關(guān)系,重構(gòu)了全球桃傳播進化路線,發(fā)現(xiàn)扁桃參與了山桃的形成,栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃,甘肅桃參與了新疆桃的形成。研究還提出了基因定位新策略GWASPV,在40個農(nóng)藝性狀、51個環(huán)境性狀和1857個代謝物性狀的基因定位中應(yīng)用,新發(fā)現(xiàn)了2000多個關(guān)聯(lián)變異,實現(xiàn)了很多性狀關(guān)鍵基因和功能變異的一步鑒定,顯著提高了基因定位和基因發(fā)掘效率,為桃分子育種提供了理論依據(jù)和基因資源。
該研究得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然基金、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青創(chuàng)專項等項目的資助。(通訊員:趙倩)
原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205225001352?via%3Dihub